АСБК с 2004 года занимается сохранением биоразнообразия Казахстана. Вся работа проводится на научной основе, так как проблемы сохранения биоразнообразия не могут быть решены без фундаментальных исследований.

Некоторые виды животных являются очень хорошими индикаторами состояния окружающей среды. Определив состояние вида, его биологические и экологические особенности, выявив угрозы и способы сохранения, можно поддерживать гармоничное существование всей экосистемы, а следом и всего биоразнообразия.  Основные виды, по которым на сегодняшний день работает АСБК - сайгак, джейран, кулан, лошадь Пржевальского, волк, снежный барс, сообщества мелких грызунов степной зоны, кречетка, пискулька, краснозобая казарка, степной орел, семиреченский лягушкозуб.